Thibaut Armel Cherif GNIMADI

PhD Student en Génomique & Bioinformatique

  • Fonction :
    Bioinformatician
  • Formation :
    PharmD, MSc, PhD Cand

Biography

Thibaut Armel Cherif GNIMADI est un pharmacien spécialisé en microbiologie et immunologie, titulaire d’une maîtrise dans ces domaines. Actuellement, il poursuit un doctorat (PhD) en Bio-informatique avec un focus sur l’application de la bio-informatique à la surveillance de la résistance aux antimicrobiens (RAM). Son intérêt se porte également sur l’épidémiologie moléculaire et évolution virale.

Passionné par le renforcement des capacités, Armel joue un rôle actif dans le développement et la formation en bio-informatique en Guinée. Il est également impliqué dans des initiatives de surveillance génomique du SRAS-CoV-2 et d’autres pathogènes émergents tels que les arbovirus.

Son objectif est de suivre les pathogènes tels que les virus et les bactéries grâce à une approche génomique en utilisant l’épidémiologie moléculaire et des outils de bio-informatique tels que la phylogénie et la phylogéographie. Il vise à comprendre les causes de la propagation, de la variation et de la résistance de ces agents pathogènes afin de pouvoir réagir rapidement et efficacement face à l’émergence et à la ré-émergence des maladies infectieuses.

En tant qu’apprenti-chercheur au Centre de recherche et de formation en infectiologie de Guinée (CERFIG), Armel est responsable de la gestion des données de laboratoire et de l’analyse bio-informatique du SRAS-CoV-2 dans le cadre du projet AFROSCREEN depuis juin 2021.

Doté d’une expérience dans l’analyse des données de santé, Armel maîtrise les données quantitatives. Il est à l’aise avec la manipulation des données en utilisant des langages tels que Python (Pandas, Matplotlib, Seaborn) et R. Il possède également une bonne connaissance du système Linux et est capable de développer et exécuter des pipelines d’analyse de données génomiques

Education

  • 2023 – 2027 : PhD Candidat, Bio-informatique, Cotutelle de thèse Conservatoire National des Arts et Métiers (CNAM), Paris & UGANC
  • 2021 – 2023 : MSc, Microbiologie et Immunologie, parcours microbiologie – Université Gamal Abdel Nasser de Conakry (UGANC)
  • 2014 – 2020 : PharmD, Doctorat d’Etat en Pharmacie – Université Gamal Abdel Nasser de Conakry (UGANC)