Thibaut Armel Cherif GNIMADI

[En] Dr. Thibaut Armel Cherif GNIMADI is a pharmacist specialized in microbiology and immunology, holding a master’s degree in these fields. Currently, he is pursuing a Ph.D. in Bioinformatics with a focus on the application of bioinformatics in antimicrobial resistance (AMR) surveillance. His interests also include molecular epidemiology and viral evolution.

Passionate about capacity building, Armel plays an active role in the development and training of bioinformatics in Guinea. He is also involved in genomic surveillance initiatives of SARS-CoV-2 and other emerging pathogens such as arboviruses.

His goal is to track pathogens like viruses and bacteria through a genomic approach, using molecular epidemiology and bioinformatics tools such as phylogeny and phylogeography. He aims to understand the causes of pathogen spread, variation, and resistance to respond quickly and effectively to the emergence and re-emergence of infectious diseases.

As a research apprentice at the Centre de Recherche et de Formation en Infectiologie de Guinée (CERFIG), Armel is responsible for laboratory data management and bioinformatics analysis of SARS-CoV-2 in the AFROSCREEN project since June 2021.

With experience in health data analysis, Armel is proficient in handling quantitative data. He is comfortable with data manipulation using programming languages such as Python (Pandas, Matplotlib, Seaborn) and R. He also possesses a strong understanding of the Linux system and can develop and execute pipelines for genomic data analysis.

[Fr] Dr. Thibaut Armel Cherif GNIMADI est un pharmacien spécialisé en microbiologie et immunologie, titulaire d’une maîtrise dans ces domaines. Actuellement, il poursuit un doctorat (PhD) en Bio-informatique avec un focus sur l’application de la bio-informatique à la surveillance de la résistance aux antimicrobiens (RAM). Son intérêt se porte également sur l’épidémiologie moléculaire et évolution virale.

Passionné par le renforcement des capacités, Armel joue un rôle actif dans le développement et la formation en bioinformatique en Guinée. Il est également impliqué dans des initiatives de surveillance génomique du SRAS-CoV-2 et d’autres pathogènes émergents tels que les arbovirus.

Son objectif est de suivre les pathogènes tels que les virus et les bactéries grâce à une approche génomique en utilisant l’épidémiologie moléculaire et des outils de bioinformatique tels que la phylogénie et la phylogéographie. Il vise à comprendre les causes de la propagation, de la variation et de la résistance de ces agents pathogènes afin de pouvoir réagir rapidement et efficacement face à l’émergence et à la réémergence des maladies infectieuses.

En tant qu’apprenti-chercheur au Centre de recherche et de formation en infectiologie de Guinée (CERFIG), Armel est responsable de la gestion des données de laboratoire et de l’analyse bioinformatique du SRAS-CoV-2 dans le cadre du projet AFROSCREEN depuis juin 2021.

Doté d’une expérience dans l’analyse des données de santé, Armel maîtrise les données quantitatives. Il est à l’aise avec la manipulation des données en utilisant des langages tels que Python (Pandas, Matplotlib, Seaborn) et R. Il possède également une bonne connaissance du système Linux et est capable de développer et exécuter des pipelines d’analyse de données génomiques